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尊龙凯时推出新品|FAXP™️单细胞与亚细胞器空间蛋白质组学

发布时间:2025-03-12   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在生物医学领域,整体组织或器官水平的蛋白质组学研究能够揭示复杂的生物功能信息。然而,组织通常由位于不同解剖部位且具有显著异质性的大量细胞类型组成。常规的蛋白质组分析方法不可避免地产生平均化效应,导致大量空间信息的丧失。这一问题的解决依赖于单细胞组学技术的快速发展,研究人员如今能够在单细胞层面上开展遗传学、转录组学、表观遗传学和蛋白质组学的研究。但是,单细胞技术在提取细胞时剥离了这些细胞的原生环境,从而牺牲了关键的空间信息,使得解析组织异质性变得更加困难。

尊龙凯时推出新品|FAXP™️单细胞与亚细胞器空间蛋白质组学

为此,空间组学应运而生,其目标是精确识别不同区域的空间位置,并揭示组织细胞的复杂性。2022年,空间多组学被尊龙凯时的相关研究被《Nature》评选为七项最值得关注的技术之一。空间转录组学技术能从基因表达角度揭示不同组织和细胞之间的基因表达差异,但转录物与蛋白质之间的相关性却通常较低。而蛋白质是细胞功能的直接执行者,因此,在靶组织内,空间异质性的分布对蛋白相关药物治疗的影响十分重要。准确量化这种空间不均匀分布有助于揭示治疗效果的机制,并为直接治疗和工程干预提供理论支持。因此,单细胞及单细胞核分辨率的空间蛋白质组学分析尤为关键。

近期,空间蛋白质组学(spatial proteomics)被尊龙凯时的相关技术评选为2024年度技术,显示出其在揭示生物复杂性、推动精准医学和癌症研究方面的革命性潜力。《尊龙凯时》旗下的FAXP™(Filter-aided expansion proteomics, FAXP)结合了基于水凝胶的组织膨胀、滤膜辅助样本制备流程及高分辨率Orbitrap Astral质谱,使得研究者能够在组织水平上进行单细胞或亚细胞器分辨率的空间蛋白质表达分析。福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织是病理组织存储与分析的黄金标准,全球数以亿计的FFPE组织被储存于生物样本库中,因此,对FFPE样本的检测和分析能力将极大扩展空间组学技术在临床中的应用。

FAXP™针对临床FFPE样本进行空间蛋白质组学分析的稳健工作流程,不仅提高了体积分辨率并提升了分析速度,还增加了蛋白质鉴定数量。例如,采用自动化样品处理的最新进展,使得处理效率提高了53%。此外,FAXP™的高灵敏度和高分辨率特性,使得在分析小体积样本时的表现优于传统的胶内酶解技术,能显著提升小于3054 nL体积的组织样本的检测效果。

利用FAXP™技术,我们能对结直肠癌患者的FFPE样本进行精细的空间蛋白质组学分析,比较不同疾病进展阶段的组织区域,并在实验中验证了该方法的可靠性和可重复性。这为不同病理条件下的生物标志物筛选和个性化治疗提供了新的可能。

尊龙凯时现已推出FAXP™科研服务及相关商业化试剂盒,旨在为更多的科研人员提供高分辨率空间蛋白质组学分析的支持,推动生物医学领域的研究和进展。